1、光源部分包括：石英汞燈石英質外殼內充填超高壓或高壓汞氣的燈管；消球差透鏡。通過該透鏡可使由光源來的光線形成清晰而平行的光束；激勵濾光片。為了濾掉由燈管所發出的其他非紫外光部分，選用光譜波長為365納米的紫外光濾光片，使光源成為紫外光源。

    2、熒光顯微鏡儀器主體部分與生物顯微鏡構造基本相同，具有臺下棱鏡、臺下聚光鏡及載物臺等，先進的還具有偏光裝置。

    3、熒光顯微鏡物鏡及目鏡鏡頭具有一套顯微目鏡和顯微物鏡系統，它是在可見光通過與發熒光物體的光程范圍內的條件下，進行肉眼觀察和在紫外線透射光下照相用的，常配有石英螢石物鏡、玻璃透鏡、消色差物鏡等。

    4、熒光顯微鏡抑制濾光片為了保護觀察者的眼睛，在進入目鏡的光路前安上一個波長在436納米以上的濾光片，它幾乎完全吸收了波長短于365納米的紫外光線。

    透射光系統由光源產生紫外光，經儀器的主體透射到載物臺的巖石薄片上，再經物鏡、目鏡直接投射到觀察者的眼睛中。該系統是用來觀察巖石薄片中所含烴類物質的各個組成。