在數字病理和生命科學的研究中，切片掃描儀已成為實現組織樣本數字化的關鍵工具。所謂“切片掃描層數”，其實指的是掃描儀在掃描玻璃切片時，在垂直方向（Z軸）上拍攝的圖像層數。這些層數可以提供不同焦深的圖像，有助于獲得更加清晰、立體的信息，也常用于三維重建或深度學習應用。

一、掃描層數的基本原理

切片掃描層數，來源于“Z-stack掃描”技術。玻璃切片雖然看似二維，但由于樣本厚度不完全一致，加上組織結構復雜，有時候單層聚焦難以涵蓋所有重要細節。為此，掃描儀會以設定的步長（比如每次上下移動0.5微米）在垂直方向逐層移動焦點，每一層聚焦拍攝一張圖像，從而構建出一個具有深度信息的圖像組，這就是“Z層掃描”。

例如：

設置的掃描厚度為5微米；

步長為0.5微米；

那么一共拍攝了11張圖像；

這就表示掃描層數為11。

二、掃描層數怎么看——從設備和軟件角度

1. 在掃描儀操作界面中查看

不同品牌的切片掃描儀在進行Z-stack掃描時，一般會在操作界面提供掃描參數的設置與顯示。例如：

設置Z-stack時，會顯示總厚度和步長；

設備會自動計算出總層數（Total Layers）；

部分設備在掃描完畢后，圖像信息欄中會顯示“掃描層數”或“Z-layers”字段。

2. 在圖像瀏覽軟件中查看

完成掃描后，用戶可以通過專業圖像瀏覽或分析軟件查看切片的圖層信息。這些軟件通常支持Z軸瀏覽，即在不同聚焦層之間進行切換。

常見軟件包括：

CaseViewer（用于3DHISTECH）；

NDP.view2（用于Hamamatsu）；

ImageScope（用于Leica Aperio）；

Motic DSAssistant（用于Motic EasyScan）；

QuPath 或 ImageJ（適用于通用格式）；

進入圖像后，在“圖像屬性”、“圖層導航器”或右下角的Z軸滾動欄中，都可以查看當前總層數和當前位置。例如，滾動條顯示為“Layer 5 of 11”，即第5層，共11層。

3. 查看圖像文件結構

數字切片的文件格式如 .ndpi、.svs、.czi、.tif 等，許多支持多層嵌套。可以使用以下方法判斷層數：

打開切片文件時，圖像查看器會識別是否為Z-stack圖像；

某些軟件能顯示每一層的縮略圖；

如果將切片圖像導出為圖像序列（如一層一張TIFF圖），文件數量就是掃描層數。

三、為什么要關注掃描層數

獲取清晰圖像：不同組織深度的細節可能不在同一焦平面上，使用多層圖像可以解決聚焦不清的問題。

輔助三維重建：某些高端軟件可以將Z-stack圖像用于3D建模，尤其適合神經元追蹤、血管結構重構等。

提高AI識別準確率：AI模型在訓練和識別過程中，使用多層圖像能獲取更全面的特征。

四、注意事項和建議

不是所有設備都支持Z-stack：部分低端或老型號掃描儀只能進行單層掃描。

掃描層數過多數據量龐大：層數多意味著數據量增大，存儲和處理成本更高。應根據實際需求設定。

掃描前需根據組織厚度設定合適參數：厚組織建議掃描多層，薄切片可以選擇單層或少層。

五、實際操作建議

掃描前規劃參數：

判斷是否需要Z-stack；

設定好Z方向總厚度和每層步長；

軟件會自動顯示預計層數。

查看圖像時切換層數：

利用滾輪、滑條或“上一層/下一層”按鈕，切換層面；

檢查目標區域在不同層上的聚焦情況。

導出圖像時保留層信息：

若需分析或備份，應選擇導出Z-stack圖像序列而非單層合成圖。

六、總結

切片掃描中的“層數”，本質上是數字化圖像獲取在Z軸方向上的延伸，是現代數字病理中獲取立體清晰圖像的重要手段。用戶可以通過設備界面、專業軟件、圖像導出等方式查看掃描層數，從而掌握切片的完整圖像信息。在應用中合理設定層數、科學使用Z-stack功能，不僅能提升圖像質量，也能為后續的臨床分析、科研研究、AI開發打下堅實基礎。